上林湖越窑遗址管理单位为慈溪市上林湖越窑遗址文物保护管理所，其为全额拨款事业单位，主要职责包括负责上林湖越窑遗址的保护和日常管理、巡查、监测，开展申报世界文化遗产的各项业务工作；负责遗址公园的日常运营和遗址博物馆的免费开放，配合开展遗址的考古发掘，研究挖掘越窑青瓷文化，向公众开展宣传教育活动。

    文保所内设办公室、业务部、巡查保卫部和社教服务部。办公室主要负责行政、财务、后勤、人事等工作；业务部主要开展遗址保护和日常管理、遗址公园运营、窑址监测、考古等科研合作以及媒体宣传等工作；巡查保卫部主要负责遗址上林湖、古银锭湖、白洋湖和里杜湖四个片区180处窑址的日常巡查和博物馆安全保卫工作；社教服务部负责遗址博物馆免费开放、展厅讲解和窑址现场讲解、前台接待咨询、开展第二课堂、公众教育等。